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Fox闪氧蛋白质足迹系统
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Fox闪氧蛋白质足迹系统
产品描述:
Fox闪氧蛋白系统是一种卓越、紧凑、经济高效且安全的羟基自由基蛋白质足迹 (HRPF) 分析方法,通过在方便的台式机上使用我们专有的快速氧化 (Fox™) 蛋白质足迹系统替代昂贵、复杂和危险的激光器格式。
详细介绍
详细参数
产品概述
Fox闪氧蛋白系统是一种卓越、紧凑、经济高效且安全的羟基自由基蛋白质足迹(HRPF)分析方法,通过在方便的台式机上使用我们专有的快速氧化(Fox™)蛋白质足迹系统替代昂贵、复杂和危险的激光器格式。
为了应对重现性挑战,GenNext开发了Fox自由基剂量计——世界上第一个OH自由基测量系统,在面对不可预测和变化的背景清除时自动控制有效OH自由基的产生。Fox剂量计提供OH自由基浓度的实时测量,使在进行质谱分析之前检测生物制药溶液或测定条件的问题变得简单,极大地提高了HRPF的易用性,同时确保了标记的可信度和保真度。
为了消除当今的生物信息学和数据处理瓶颈,GenNext推出了FoxWare™数据处理——一种独特的数据处理程序,专门为恰当地解决和自动化HRPF HOS分析的数据处理需求而定制。
Fox系统的独特优势
溶剂可及性的直接评估
通过Fox足迹法研究各种蛋白质类别和系统所获得的见解有可能极大地影响药物发现和开发过程中每个阶段的决策。从而设计和生产出更安全、更有效、更稳定的生物疗法。
高级结构验证
Fox系统通过确认蛋白质的正确折叠和组装来验证复杂生物制品(如单克隆抗体)的高阶结构。通过将实验Fox数据与基于已知蛋白质结构的预期溶剂可及性进行比较,研究人员可以评估生物高阶结构的结构完整性和准确性。
高空间分辨率
Fox系统提供有关蛋白质结构的高空间分辨率信息。它可以精确定位蛋白质中溶剂可及或被掩埋的特定氨基酸和区域。这种细节水平使研究人员能够绘制蛋白质表面图,并准确识别参与蛋白质-蛋白质或蛋白质-配体相互作用的区域。
跨蛋白质类别的通用性
Fox系统处理广泛的蛋白质类别,包括可溶性蛋白质、膜蛋白质和蛋白质复合物。它不受蛋白质大小、类型或结构的限制,使研究人员能够使用这项技术研究不同的蛋白质系统。能够处理非常大和异构的系统,Fox系统产生的见解有助于更好地理解它们的功能和通信。
对其他技术的补充
Fox系统补充了其他结构生物学技术,如X射线晶体学、核磁共振波谱仪(NMR)、氢/氘交换(HDX)和冷冻电镜(cryo-EM)。它提供了在天然溶液状态条件下溶剂可及性和动力学的信息,而其他方法可能无法获得这些信息。通过将Fox-HRPF方法与其他技术相结合,研究人员可以更全面地了解蛋白质的结构和功能。
通过Fox系统的新见解
蛋白质-蛋白质相互作用
Fox®系统识别蛋白质-蛋白质相互作用位点和界面。通过测量蛋白质-蛋白质相互作用如何改变相互作用界面残基的溶剂可及性,Fox系统可以精确定位负责结合的区域或结构域。这些信息有助于研究人员了解蛋白质相互作用的结构基础,包括涉及单克隆抗体及其靶抗原或其他相互作用蛋白质的相互作用。
表位映射
Fox系统产生了关于抗体-抗原相互作用中残基的溶剂可及性的有价值的信息,并且可以快速、可靠地识别结合时发生的变 化。这种方法允许鉴定和绘制单克隆抗体上的表位,从而深入了解结合界面和负责抗原识别的区域。这些知识对于治疗性抗体和诊断试剂的设计和优化至关重要。
蛋白质配体相互作用的表征
Fox系统揭示了有关蛋白质-配体相互作用的有价值的信息。通过评估配体结合时溶剂可及性的变化,Fox系统可以识别参与结合位点的残基,并揭示配体诱导的构象变化。这些信息有助于理解结合机制并指导药物发现工作。
蛋白质折叠与构象变化
Fox系统检测蛋白质内的构象变化和动力学。通过比较不同条件或时间点的Fox数据,研究人员可以识别出发生结构重排、暴露或屏蔽某些残基的区域或结构域。这种能力允许研究构象动力学,例如配体诱导的构象变化或对环境因素的结构反应。
识别受变构影响的区域
Fox系统识别受变构影响的区域,这些区域对于理解蛋白质如何传递信号和发生功能变化至关重要。通过揭示受变构影响的区域,基于Fox的HRPF方法有助于阐明蛋白质功能的潜在机制,并有助于针对变构位点的药物发现工作。
糖蛋白分析
Fox系统揭示了糖蛋白的溶剂可及性。聚糖保护某些氨基酸不被氧化,使研究人员能够了解聚糖与蛋白质的相互作用。此外,该方法有助于分析各种条件下糖蛋白的构象变化和糖蛋白与蛋白质的相互作用,从而更全面地了解糖蛋白的结构和功能。
图1:HRPF方法示意图,蛋白质的快速光化学氧化(FPOP)。
使用FPOP,蛋白质与过氧化氢混合,并通过脉冲紫外线光源,该光源将过氧化氢光解为两种•OH,氧化溶剂暴露的氨基酸。标记后,将样品放入过氧化氢酶和蛋氨酸的骤冷溶液中,进行消化,并使用高分辨率LC-MS/MS进行分析。
应用领域
单克隆抗体
表位作图
互补位映射
聚合
配方研究
生物仿制药开发
原始比较
药物靶点发现
药物结合位点
变构效应
生物分子相互作用
蛋白质-配体
蛋白质-蛋白质
详细参数